24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1943 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1943  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 191 aa  358  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.91 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08130  hypothetical protein  39.01 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  36.49 
 
 		 297 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  42.5 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  29.08 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  31.36 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  31.36 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  27.1 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.97 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  31.62 
 
 		 289 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.19 
 
 		 309 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2624  hypothetical protein  34.88 
 
 		 412 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  28.3 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.44 
 
 		 270 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  25.16 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  30.51 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 		 290 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.62 
 
 		 86 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.44 
 
 		 86 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.17 
 
 		 286 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.21 
 
 		 87 aa  41.6  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.21 
 
 		 289 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.21 
 
 		 289 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>