14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1430 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.0390822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5082  ABC-2 type transporter  75.1 
 
 		 302 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  49.79 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  41.35 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  30.26 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.32 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  35.78 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.32 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>