More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1407 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1407  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00650999  hitchhiker  0.00170065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  73.35 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.73 
 
 
316 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.62 
 
 
327 aa  358  8e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3446  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.54 
 
 
372 aa  355  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3220  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.07 
 
 
371 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0668029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.19 
 
 
319 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0302613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.44 
 
 
391 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1276  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.66 
 
 
351 aa  345  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.31 
 
 
336 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22880  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.22 
 
 
346 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.555108  normal  0.0421378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
332 aa  338  9e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1588  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.96 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120607  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1102  methyltransferase  63.48 
 
 
330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.498999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2934  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.28 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00284592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5774  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.44 
 
 
316 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1066  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.78 
 
 
334 aa  326  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1563  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.38 
 
 
330 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2418  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.33 
 
 
333 aa  324  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0532516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.87 
 
 
330 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.34 
 
 
371 aa  322  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.62 
 
 
348 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00956615  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3531  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.37 
 
 
378 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0334223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0888  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.79 
 
 
357 aa  311  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127807  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2654  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.87 
 
 
331 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.24 
 
 
335 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0807568  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1002  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.73 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.35272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12195  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.91 
 
 
396 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0705243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3275  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.06 
 
 
324 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2862  S-adenosylmethionine-dependentmethyltransferase  59.04 
 
 
330 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1399  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.48 
 
 
327 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  0.0101144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10730  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.19 
 
 
331 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101108  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13680  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 
331 aa  293  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3025  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.18 
 
 
336 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3264  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.06 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3326  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.06 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.33134  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1109  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.44 
 
 
345 aa  269  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.694577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.19 
 
 
291 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.09 
 
 
315 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.93 
 
 
316 aa  245  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.64 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
310 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.36 
 
 
310 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.1 
 
 
311 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.95 
 
 
312 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.45 
 
 
310 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.45 
 
 
310 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.71 
 
 
310 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.17 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09570  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.65 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.142549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.71 
 
 
310 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.84 
 
 
313 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.71 
 
 
310 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.71 
 
 
310 aa  235  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.71 
 
 
310 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.36 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.36 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.01 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.1 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.36 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.25 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.63 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1444  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.32 
 
 
324 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0770792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
310 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08780  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.74 
 
 
318 aa  229  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000136527 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.72 
 
 
311 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  48.86 
 
 
314 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.72 
 
 
311 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.01 
 
 
311 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.39 
 
 
303 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.07 
 
 
313 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.93 
 
 
318 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.00489448 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0585  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.21 
 
 
318 aa  226  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3777  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.75 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.16 
 
 
311 aa  225  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.93 
 
 
323 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.39 
 
 
312 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1209  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.44 
 
 
315 aa  223  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.034127  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.48 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.53 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.01 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.31 
 
 
312 aa  219  7e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0476  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.69 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00757887  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.39 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.48 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
325 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  43.27 
 
 
318 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.68 
 
 
311 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.26 
 
 
327 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.28 
 
 
316 aa  216  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.39 
 
 
307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.22 
 
 
321 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4473  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.42 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.33 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.92 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.58 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.2 
 
 
310 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.77 
 
 
327 aa  211  9e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.41 
 
 
349 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>