18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1700 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1700  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1142  biotin synthetase-like protein  57.96 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0942  radical SAM domain-containing protein  51.22 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0920  radical SAM domain-containing protein  51.22 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0171174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1948  radical SAM domain-containing protein  35.74 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1519  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.21 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0647  Radical SAM domain protein  31 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1054  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.910454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0446  radical SAM family protein  28.89 
 
 		 325 aa  88.6  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0641  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 392 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.071148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1071  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000639337  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2087  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1507  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2207  radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 407 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2174  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2546  radical SAM domain protein  25 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1559  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0415302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>