23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1047 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  686    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  61.08 
 
 
329 aa  430  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  49.03 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  48.7 
 
 
316 aa  319  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  44.51 
 
 
337 aa  311  7.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  27.51 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
285 aa  112  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  28.82 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  27.08 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  27.21 
 
 
302 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  28.09 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4751  esterase  24.31 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4721  esterase  24.31 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  28.46 
 
 
481 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  22.86 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5707  esterase  23.61 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3823  esterase  24.83 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000203286 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  19.84 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4434  esterase  24.31 
 
 
249 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04057  predicted hydrolase  23.61 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04019  hypothetical protein  23.61 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3803  phospholipase/Carboxylesterase  23.61 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  21.26 
 
 
333 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>