More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0616 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  100 
 
 		 74 aa  143  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  71.83 
 
 		 76 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  57.53 
 
 		 77 aa  87.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  53.62 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  55.71 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  61.19 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 76 aa  80.1  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  60.94 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  52.78 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  51.35 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  59.7 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  60.29 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  51.39 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  56.52 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  56.72 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  50 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  56.34 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  56.52 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  56.52 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  55.71 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  50.68 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  58.46 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  51.32 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  58.46 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  55.07 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  52.86 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  53.62 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  50.72 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  52.05 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  52.86 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  54.93 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  54.93 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  56.72 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  53.52 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  51.35 
 
 		 78 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  52.11 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  52.78 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>