15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4285 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4285  TraE family protein  100 
 
 
193 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  33.69 
 
 
187 aa  101  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  33.87 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  26.09 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  24.24 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  24.24 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  24.84 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  24.84 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  24.84 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  29.52 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  29.52 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  28.57 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6792  hypothetical protein  24.52 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  24.71 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>