46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1877 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1877  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  194  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0504  hypothetical protein  52.75 
 
 
98 aa  97.4  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  48.91 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  36.36 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  32.95 
 
 
94 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  32.18 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  32.18 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  32.18 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  32.56 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  32.56 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  34.52 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  31.4 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  32.14 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  32.56 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  32.22 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  34.52 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  34.52 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  33.33 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  30.95 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  28.89 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  32.14 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  33.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  36.92 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  33.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  33.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  33.33 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  38.1 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  32.14 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  30.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  32.14 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  27.17 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  32.18 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  32.05 
 
 
101 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  31.4 
 
 
92 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  25.56 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  32.31 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  32.43 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  32.79 
 
 
95 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  38.78 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  38.78 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>