19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0154 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0154  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  26.28 
 
 
178 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  28.68 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  33.33 
 
 
161 aa  50.1  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  26.47 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  26.47 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  28.57 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  25.55 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  32.61 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  25.74 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  27.12 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  30.11 
 
 
306 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  31.11 
 
 
292 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  24.82 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  31.88 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  31.88 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  31.88 
 
 
171 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>