18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0732 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0732  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  780    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04270  hypothetical protein  47.92 
 
 
388 aa  363  2e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2315  hypothetical protein  45.82 
 
 
397 aa  348  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  44.36 
 
 
382 aa  335  5e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2522  hypothetical protein  38.34 
 
 
404 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.101837  normal  0.542859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2120  hypothetical protein  38.62 
 
 
389 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.78 
 
 
407 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.23 
 
 
403 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.23 
 
 
403 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.27 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.08 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.29 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
914 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
900 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  26.6 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.98 
 
 
405 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  23.81 
 
 
411 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.9 
 
 
900 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>