22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2760 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  67.23 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  57.34 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  57.34 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  64.96 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  63.25 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  49.64 
 
 		 210 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  47.95 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  58.02 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  34.62 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  36 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  29.87 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  26.17 
 
 		 145 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  41.18 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  41.18 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  40 
 
 		 247 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  31.25 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  36.92 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  37.68 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  37.68 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  36.92 
 
 		 200 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  36.92 
 
 		 200 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>