25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0832 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0816  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0832  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3009  hypothetical protein  98.83 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3036  hypothetical protein  98.05 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02671  hypothetical protein  98.05 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4166  hypothetical protein  98.44 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02709  hypothetical protein  98.05 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3201  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2139  hypothetical protein  33.47 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2832  hypothetical protein  39.23 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2762  uncharacterized MobA-related protein-like protein  34.36 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  34.11 
 
 		 455 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1685  hypothetical protein  32.51 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1491  hypothetical protein  36.76 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3933  anaerobic dehydrogenase cluster protein  30.46 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2112  anaerobic dehydrogenase cluster protein  26.7 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0034  hypothetical protein  29.44 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0359  hypothetical protein  25.11 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0179  uncharacterized MobA-related protein-like protein  30.58 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0247  hypothetical protein  29.73 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.333504 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  31.69 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1463  anaerobic dehydrogenase cluster protein  24.04 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2206  hypothetical protein  28.87 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1305  anaerobic dehydrogenase cluster protein  27.75 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0835  hypothetical protein  26.03 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>