12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4784 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  400  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  97.34 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  41.08 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  32.04 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  31.76 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  31.18 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  32.73 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  27.22 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  27.75 
 
 		 361 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  28.89 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  23.95 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  21.88 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>