37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3357 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  100 
 
 		 551 aa  1129    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  35.71 
 
 		 570 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  34.08 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  33.05 
 
 		 569 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  30.24 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  24.56 
 
 		 575 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  32.39 
 
 		 398 aa  133  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  24.78 
 
 		 569 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  24.15 
 
 		 599 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  28.74 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  25.21 
 
 		 616 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  24.96 
 
 		 612 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  26.69 
 
 		 640 aa  106  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  22.93 
 
 		 595 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  27.59 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  28.45 
 
 		 642 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  30.27 
 
 		 318 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  32.45 
 
 		 627 aa  91.3  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  32.9 
 
 		 615 aa  90.9  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  31.55 
 
 		 639 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  32.09 
 
 		 639 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  31.55 
 
 		 643 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  32.28 
 
 		 615 aa  87.4  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  32.47 
 
 		 614 aa  87  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  31.38 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  30.32 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  33.55 
 
 		 680 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  30.69 
 
 		 621 aa  80.5  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  32.9 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  30.34 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  27.04 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  31.74 
 
 		 623 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  25.12 
 
 		 624 aa  70.5  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  27.69 
 
 		 282 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  23.98 
 
 		 861 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  27.19 
 
 		 308 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  25.44 
 
 		 611 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>