25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3201 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3201  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  486  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0816  conserved hypothetical protein  99.57 
 
 
256 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0832  hypothetical protein  99.57 
 
 
256 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.828013  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3009  hypothetical protein  98.72 
 
 
256 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3036  hypothetical protein  97.87 
 
 
256 aa  477  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02709  hypothetical protein  97.87 
 
 
256 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4166  hypothetical protein  98.3 
 
 
256 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02671  hypothetical protein  97.87 
 
 
256 aa  477  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2139  hypothetical protein  33.06 
 
 
260 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2832  hypothetical protein  38.76 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2762  uncharacterized MobA-related protein-like protein  35.08 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  34.31 
 
 
455 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1491  hypothetical protein  36.84 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1685  hypothetical protein  31.44 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3933  anaerobic dehydrogenase cluster protein  30.46 
 
 
253 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.239869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2112  anaerobic dehydrogenase cluster protein  26.7 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0034  hypothetical protein  29.72 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0359  hypothetical protein  25.11 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0179  uncharacterized MobA-related protein-like protein  30.1 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0247  hypothetical protein  29.51 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.333504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1463  anaerobic dehydrogenase cluster protein  24.04 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  30.99 
 
 
394 aa  63.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2206  hypothetical protein  28.87 
 
 
350 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1305  anaerobic dehydrogenase cluster protein  28.09 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355701  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0835  hypothetical protein  26.03 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>