29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2981 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  98.72 
 
 
235 aa  484  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  97.87 
 
 
235 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  97.87 
 
 
235 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  97.02 
 
 
235 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.622505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  95.32 
 
 
235 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  59.57 
 
 
235 aa  291  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  59.15 
 
 
235 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  59.15 
 
 
235 aa  289  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  59.15 
 
 
235 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  58.72 
 
 
235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  58.3 
 
 
231 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  58.3 
 
 
231 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  58.3 
 
 
231 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  57.87 
 
 
231 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  61.27 
 
 
204 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  60.78 
 
 
204 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  60.78 
 
 
204 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  60.78 
 
 
204 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  37.66 
 
 
234 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  36.36 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  41.28 
 
 
231 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0603  hypothetical protein  91.89 
 
 
37 aa  71.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  34.88 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  24.7 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  23.75 
 
 
286 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3200  hypothetical protein  28.44 
 
 
225 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.851547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2975  hypothetical protein  28.44 
 
 
225 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>