49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0307 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  100 
 
 
206 aa  413  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  78.01 
 
 
200 aa  313  9.999999999999999e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  34.31 
 
 
196 aa  121  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0841  CvpA family protein  27.43 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.697503  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  21.7 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  26.82 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  20.1 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  35.71 
 
 
177 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  35.71 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  21.8 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  21.9 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  22.64 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  22.54 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  22.69 
 
 
213 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  20.59 
 
 
234 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  33.05 
 
 
164 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  34.58 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  22.94 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  34.58 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  24.74 
 
 
190 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  31.78 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  31.78 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  31.78 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  31.78 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  22.65 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  25.27 
 
 
187 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  25.27 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  28.18 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  24.71 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  23.22 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  28.44 
 
 
165 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  23.22 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  20.57 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  26.42 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  29.91 
 
 
162 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  20.3 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  31.78 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1043  Colicin V production protein  22.86 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  28.23 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  22.39 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  26.61 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  24.77 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  18.96 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  28.47 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  27.34 
 
 
158 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  21.31 
 
 
199 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  24.07 
 
 
168 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  28.68 
 
 
162 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  18.48 
 
 
197 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>