20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0335 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  490  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  98.31 
 
 
236 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  98.31 
 
 
236 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  98.31 
 
 
236 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  98.31 
 
 
236 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  97.71 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  97.25 
 
 
218 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  57.35 
 
 
220 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  33.53 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  30.51 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  29.44 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  29.78 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  29.78 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  29.44 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  29.78 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  29.21 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  25.65 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  25.19 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  25.79 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  23.49 
 
 
238 aa  42  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>