23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0299 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  289  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0072  hypothetical protein  32.37 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0377393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3010  hypothetical protein  26.53 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4540  hypothetical protein  30.08 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03720  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03669  hypothetical protein  26.49 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4210  hypothetical protein  26.49 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433081 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  26.79 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0829  hypothetical protein  30.15 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  27.35 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  25.89 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  25.64 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  26.06 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  25.87 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  26.06 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  27.35 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  24.82 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  29.91 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  29.55 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4285  hypothetical protein  27.08 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  24.46 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  29.23 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0499  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>