18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0964 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
192 aa  400  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  34.38 
 
 
162 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1509  CBS domain-containing protein  35.53 
 
 
163 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  30.41 
 
 
161 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  30.57 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0965  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
156 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000272777  normal  0.399502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  22.09 
 
 
301 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 
153 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  25.83 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1996  CBS domain-containing protein  25.15 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  18.92 
 
 
152 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0728  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109971  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  25.28 
 
 
300 aa  41.2  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  27.78 
 
 
215 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>