15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2171 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2171  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1064  hypothetical protein  51.85 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0784878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1638  hypothetical protein  43.28 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6054  hypothetical protein  48.89 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1136  hypothetical protein  48.89 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2895  hypothetical protein  41.61 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1081  hypothetical protein  41.48 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3466  gene transfer agent (GTA) orfg8  33.59 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.018674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1418  gene transfer agent (GTA) like protein  31.25 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0910  gene transfer agent (GTA) orfg8  35.94 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1978  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1815  gene transfer agent (GTA) orfg8  31.25 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00634922  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2108  gene transfer agent (GTA) like protein  31.01 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354227  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1982  gene transfer agent (GTA) orfg8  28.91 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.504072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1325  gene transfer agent  26.96 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00376041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>