27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1586 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  78.11 
 
 		 513 aa  834    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 515 aa  1058    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  78.5 
 
 		 513 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  78.11 
 
 		 513 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  73.78 
 
 		 514 aa  786    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  74.49 
 
 		 519 aa  762    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  60.04 
 
 		 523 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  52.37 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  43.54 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  43.4 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  39.57 
 
 		 519 aa  330  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  38.59 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  40.51 
 
 		 519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  38.97 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  34.12 
 
 		 468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  35.71 
 
 		 504 aa  269  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  29.41 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  28.54 
 
 		 471 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  30.31 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  30.52 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  26.9 
 
 		 515 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  26.62 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  26.37 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  29.41 
 
 		 147 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  22.82 
 
 		 334 aa  67  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  22.78 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  26.34 
 
 		 417 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>