9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0495 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0495  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.350156  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  88.66 
 
 		 740 aa  169  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 785 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 739 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 786 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 720 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  53.33 
 
 		 664 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 787 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 692 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>