19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1985 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1985  HPr kinase  100 
 
 
375 aa  780    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2699  HPr kinase  49.58 
 
 
356 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  34.9 
 
 
364 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0158  HPr kinase  35.53 
 
 
371 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0181817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1769  HPr kinase  38.57 
 
 
373 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2830  hypothetical protein  32.04 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  34.07 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4010  hypothetical protein  34.29 
 
 
337 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  30.65 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  38.46 
 
 
142 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  28.38 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3277  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family permease/ATP-binding protein CydC  30.35 
 
 
559 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.96 
 
 
142 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  26.67 
 
 
324 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  29.73 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  30.22 
 
 
142 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  29.03 
 
 
398 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  41.18 
 
 
154 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4645  HPr kinase  38.6 
 
 
276 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>