More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1709 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1709  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
453 aa  924    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.366851  normal  0.0986439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  42.73 
 
 
463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  40.33 
 
 
499 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2070  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
423 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1736  serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 
653 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
565 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  30.71 
 
 
457 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
996 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 
612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.13 
 
 
1183 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.68 
 
 
614 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
618 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.03 
 
 
1072 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  33.65 
 
 
615 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.77 
 
 
598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
601 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.79 
 
 
675 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.23 
 
 
896 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
1415 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
612 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.56 
 
 
1072 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  32.63 
 
 
519 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  30.03 
 
 
1122 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.92 
 
 
647 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 
498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
1435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
1104 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  38.03 
 
 
621 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.56 
 
 
1076 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
700 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  31.17 
 
 
583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 
687 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
895 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 
776 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
646 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
557 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.69 
 
 
627 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 
862 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.57 
 
 
603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
517 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
503 aa  114  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3960  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.04 
 
 
550 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
645 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
450 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  30 
 
 
618 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.6 
 
 
620 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.05 
 
 
625 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.56 
 
 
525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
707 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.27 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
552 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35 
 
 
673 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 
746 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
763 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.05 
 
 
632 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.71 
 
 
586 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.03 
 
 
841 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5322  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
671 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
636 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  34.21 
 
 
457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 
638 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.97 
 
 
880 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  36.11 
 
 
531 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  31.1 
 
 
626 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 
985 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.03 
 
 
1044 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
773 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
666 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 
473 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
465 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1579  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
761 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.222846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.03 
 
 
700 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
783 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  32.98 
 
 
620 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.57 
 
 
638 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 
425 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
581 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
1403 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  29.71 
 
 
609 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.96 
 
 
863 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 
611 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  32.35 
 
 
889 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
642 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
641 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
525 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
522 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>