114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2665 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  100 
 
 
377 aa  748    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  62.15 
 
 
362 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  28.1 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  29.73 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  29.69 
 
 
363 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  29.73 
 
 
363 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  29.35 
 
 
363 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  27.78 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3600  spore germination protein  26.23 
 
 
365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0670  spore germination protein GerKB  26.56 
 
 
368 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0601  spore germination protein GerKB  25.48 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0545  spore germination protein  25.48 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  25.48 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0634  spore germination protein GerKB  25.48 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3683  spore germination protein  26.28 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0690  spore germination protein GerKB  25.48 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3591  spore germination protein  25.08 
 
 
365 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  29.01 
 
 
363 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  25.08 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  24.64 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  25.08 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  28.67 
 
 
363 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  25.42 
 
 
365 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  25.2 
 
 
368 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  25.08 
 
 
365 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  26.58 
 
 
367 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1708  GerZB  26.46 
 
 
367 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000089692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  27.63 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  25.15 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  23.97 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  25.56 
 
 
368 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  26.9 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  24.13 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0391  spore germination protein GerHB  26.17 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  35.77 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1769  spore germination protein  26.2 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  26.42 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  24.59 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3120  spore germination protein QB  20.74 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  23.27 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  24.59 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  24.59 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2887  GerB family spore germination protein  20.45 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.070382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3141  spore germination protein, GerB family  20.45 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.543327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2117  spore germination protein, GerB family  19.78 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0235  spore germination protein  22.75 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  23.91 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  24.32 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0826  spore germination protein  23.05 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.724874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  22.48 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  26.01 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0200  spore germination protein B  22.47 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  22.91 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  23.4 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  27.98 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  22.68 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  25 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  24.61 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  28.18 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0893  germination protein, Ger(x)C family  23.51 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4484  spore germination protein IB  24.61 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  22.15 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4631  spore germination protein GerHB  24.61 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4985  spore germination protein GerHB  24.61 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0924  spore germination protein, GerB family  22.3 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  22.97 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4853  spore germination protein GerHB  24.61 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4465  spore germination protein IB  24.22 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4870  spore germination protein GerHB  24.22 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4845  spore germination protein GerHB  23.83 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  23.91 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  25.41 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  21.2 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  23.44 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0838  spore germination protein GerLB  23.86 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2063  spore germination protein  25.52 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.722464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  30.57 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  26.22 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  28.43 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  30.97 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  22.8 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0763  spore germination protein GerKB  27.4 
 
 
213 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  31.43 
 
 
363 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0676  spore germination protein GerLB  23.06 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  20.97 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0744  spore germination protein GerLB  23.32 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4593  spore germination protein GerLB  23.32 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0779  spore germination protein GerLB  23.06 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.56621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  25.61 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0620  spore germination protein (amino acid permease)  22.79 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  28.35 
 
 
359 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  22.07 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0598  spore germination protein  23.39 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  28.35 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  20.64 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  23.61 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  22.76 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0625  spore germination protein  22.73 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  26.07 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0620  spore germination protein (amino acid permease)  22.79 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0246676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>