18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1999 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  317  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  27.63 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1509  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  26.14 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  30.06 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  27.1 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  25.97 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0795  CBS domain-containing protein  26.86 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0152604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  26.45 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  29.7 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0965  CBS domain-containing protein  24 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000272777  normal  0.399502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2338  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0977  putative signal transduction protein with CBS domains  22.36 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121295  normal  0.444169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  18.92 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0051  putative signal transduction protein with CBS domains  26.17 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  32.98 
 
 		 493 aa  40.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>