13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1039 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  351  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3251  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  90.9  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0955  hypothetical protein  24.5 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.54 
 
 		 210 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  24.24 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  27.63 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  25.17 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  24.85 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  25.17 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  28 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  22.86 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2689  hypothetical protein  20.12 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000030695  hitchhiker  0.00743225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  23.12 
 
 		 203 aa  40.8  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>