More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0012 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0033  tRNA-Ile  91.14 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0222175  normal  0.680083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0053  tRNA-Ile  91.14 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.94 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.94 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  97.92 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  97.92 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  97.92 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  97.92 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  97.92 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  90.67 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  97.87 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  97.87 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0042  tRNA-Ile  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0031  tRNA-Ile  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0043  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0053  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>