27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1111 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 477 aa  999    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  29.79 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  29.18 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  28.09 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  27.81 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  29.09 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  29.98 
 
 		 513 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  29.98 
 
 		 513 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  30.31 
 
 		 515 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  27.72 
 
 		 515 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  29.83 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  28.91 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  27.04 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  29.09 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  26.07 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  27.81 
 
 		 523 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  27.21 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  26.83 
 
 		 517 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  25.22 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  25.92 
 
 		 519 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  24.67 
 
 		 514 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  25 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  24.84 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  26.37 
 
 		 334 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  34.31 
 
 		 147 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  20.77 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  22.37 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>