More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1105 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1105  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
198 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.323015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1134  dephospho-CoA kinase  94.44 
 
 
198 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1323  dephospho-CoA kinase  93.43 
 
 
198 aa  380  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.018005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  41.12 
 
 
207 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  42.33 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3026  dephospho-CoA kinase  39.59 
 
 
201 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00288343  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0885  dephospho-CoA kinase  40.31 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  41.4 
 
 
317 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  41.85 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2014  dephospho-CoA kinase  40.76 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  37.7 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
200 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  36.98 
 
 
200 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  37.17 
 
 
200 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
200 aa  130  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
200 aa  130  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2821  dephospho-CoA kinase  35.71 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  38.34 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  38.74 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2155  dephospho-CoA kinase  40.41 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  36.46 
 
 
200 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2074  dephospho-CoA kinase  40.11 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000294948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  40.21 
 
 
213 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  36.65 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  38.2 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  35.98 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  38.64 
 
 
198 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1838  dephospho-CoA kinase  37.95 
 
 
212 aa  124  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.329616  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0963  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 
200 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  37.06 
 
 
206 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 
199 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  36.13 
 
 
198 aa  120  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  35.42 
 
 
200 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2418  dephospho-CoA kinase  38 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0117806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  37.89 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  36.7 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  34.38 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1022  dephospho-CoA kinase  37.7 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  37.85 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  39.39 
 
 
201 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  35.36 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1252  dephospho-CoA kinase  35.57 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.324295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2971  Dephospho-CoA kinase  39.78 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  35.64 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  39.3 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  37.95 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1745  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2356  dephospho-CoA kinase  35.98 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000670117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1779  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.893439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  36.65 
 
 
197 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  34.95 
 
 
206 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  39.3 
 
 
200 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  35.45 
 
 
195 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.139689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  34.83 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  37.06 
 
 
201 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  32.66 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  32.14 
 
 
204 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1193  dephospho-CoA kinase  35.11 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.53954  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1488  dephospho-CoA kinase  31.63 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.270343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11180  dephospho-CoA kinase  36.72 
 
 
215 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1889  dephospho-CoA kinase  36.26 
 
 
196 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  36.76 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  35.32 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  36.96 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
208 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3605  dephospho-CoA kinase  35.33 
 
 
195 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.934183  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2501  dephospho-CoA kinase  35.33 
 
 
195 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
202 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  32.61 
 
 
211 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  30.05 
 
 
194 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0676  dephospho-CoA kinase  36.07 
 
 
204 aa  106  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  37.99 
 
 
203 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  37.99 
 
 
203 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  37.99 
 
 
203 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  37.99 
 
 
203 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3459  dephospho-CoA kinase  33.5 
 
 
201 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  37.99 
 
 
203 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  34.67 
 
 
201 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  37.99 
 
 
203 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  38.04 
 
 
202 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  38.04 
 
 
202 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 
204 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  35.15 
 
 
208 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  37.43 
 
 
203 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1406  dephospho-CoA kinase  36.52 
 
 
197 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.283649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 
204 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  35.52 
 
 
196 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  37.62 
 
 
200 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  37.99 
 
 
202 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 
202 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  32.67 
 
 
206 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.99 
 
 
430 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3172  dephospho-CoA kinase  33.52 
 
 
200 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>