41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4901 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4901  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3275  hypothetical protein  76.22 
 
 
151 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1420  EutP/PduV family GTP-binding protein  52.14 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1291  ethanolamine utilization protein eutP  39.72 
 
 
144 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2297  propanediol utilization protein PduV  35.71 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0887  ethanolamine utilization protein, EutP  36.43 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0086  ethanolamine utilization protein-like protein  38.3 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1041  ethanolamine utilization protein, EutP  37.41 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4865  ethanolamine utilization protein, EutP  31.85 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2648  ethanolamine utilization protein, EutP  35.71 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2392  ethanolamine utilization protein, EutP  31.43 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2226  ethanolamine utilization protein, EutP  31.43 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.183442  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2279  ethanolamine utilization protein, EutP  31.43 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0106069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2233  ethanolamine utilization protein EutP  31.43 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2179  ethanolamine utilization protein, EutP  30.71 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3263  ethanolamine utilization protein-like  33.09 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1373  ethanolamine utilization protein EutP  29.93 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1728  ethanolamine utilization protein, EutP  33.58 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1209  ethanolamine utilization protein, EutP  32.41 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1216  ethanolamine utilization protein, EutP  32.41 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2590  ethanolamine utilization protein, EutP  32.41 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2827  ethanolamine utilization protein, EutP  32.41 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02352  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.41 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02314  hypothetical protein  32.41 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3682  ethanolamine utilization protein, EutP  32.41 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2738  ethanolamine utilization protein, EutP  32.41 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2607  ethanolamine utilization protein, EutP  32.41 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2703  ethanolamine utilization protein, EutP  32.88 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2729  ethanolamine utilization protein, EutP  32.88 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2836  ethanolamine utilization protein, EutP  32.88 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2662  ethanolamine utilization protein EutP  32.88 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2614  ethanolamine utilization protein, EutP  32.88 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1937  ethanolamine utilization protein-like protein  36.45 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1228  putative ethanolamine utilization protein  27.08 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0959  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 
308 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  27.33 
 
 
453 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  35.04 
 
 
300 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  27.04 
 
 
310 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  23.87 
 
 
287 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 
313 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  26.58 
 
 
327 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>