25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2249 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2249  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 
412 aa  847    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0786  putative transmembrane anti-sigma factor  26.62 
 
 
386 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1806  putative transmembrane anti-sigma factor  28.26 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0959  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.54 
 
 
382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.261704  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4280  hypothetical protein  32.57 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal  0.0241323 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3132  putative transmembrane anti-sigma factor  31.82 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2465  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000108785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1022  hypothetical protein  31.82 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2500  hypothetical protein  32.69 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2731  hypothetical protein  32.69 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000018372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2739  hypothetical protein  32.05 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77889e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2544  hypothetical protein  32.69 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000080161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3940  putative transmembrane anti-sigma factor  30.77 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000279059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0460  hypothetical protein  28.39 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2698  putative transmembrane anti-sigma factor  25.62 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1235  putative transmembrane anti-sigma factor  23.27 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143164  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.22 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  37.04 
 
 
336 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  27.61 
 
 
347 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  29.63 
 
 
276 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1486  hypothetical protein  23.6 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  21.3 
 
 
221 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  28.76 
 
 
212 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  36.36 
 
 
329 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>