27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1730 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 476 aa  988    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  39.05 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  38.38 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  33.11 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  30.89 
 
 		 523 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  32.05 
 
 		 514 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  30.15 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  29.41 
 
 		 515 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  33.41 
 
 		 519 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  29.85 
 
 		 513 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  29.85 
 
 		 513 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  29.74 
 
 		 513 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  29.39 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  32.51 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  30.48 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  28.3 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  29.67 
 
 		 519 aa  192  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  29.83 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  28.18 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  25.64 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  25.22 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  26.36 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  25.21 
 
 		 515 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  26.95 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  25.36 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  34.29 
 
 		 410 aa  53.5  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  26.09 
 
 		 147 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>