27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1728 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 468 aa  976    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  45.16 
 
 		 476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  37.1 
 
 		 523 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  38.38 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  37.58 
 
 		 513 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  37.98 
 
 		 514 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  37.58 
 
 		 513 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  36.93 
 
 		 513 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  35.85 
 
 		 514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  36.62 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  34.2 
 
 		 517 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  33.33 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  34.12 
 
 		 515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  34.42 
 
 		 519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  34.48 
 
 		 519 aa  256  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  32.74 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  33.12 
 
 		 519 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  31.67 
 
 		 504 aa  228  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  28.21 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  29.18 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  28.24 
 
 		 510 aa  186  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  30.75 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  24.95 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  24.69 
 
 		 334 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  34.38 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  20.51 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  20 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>