58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2960 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  100 
 
 		 322 aa  638    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  43.61 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  44.59 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  38.53 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  37.6 
 
 		 539 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.1 
 
 		 515 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  36.27 
 
 		 590 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  35.35 
 
 		 579 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.9 
 
 		 605 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  33.44 
 
 		 537 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.57 
 
 		 540 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  36.02 
 
 		 538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  35.85 
 
 		 538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  35.86 
 
 		 546 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  34.87 
 
 		 588 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  34.04 
 
 		 565 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  33.12 
 
 		 509 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  33.12 
 
 		 509 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  34.88 
 
 		 545 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  34.51 
 
 		 551 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.29 
 
 		 584 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.2 
 
 		 602 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.2 
 
 		 602 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  34.56 
 
 		 515 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  34.19 
 
 		 579 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  34.41 
 
 		 552 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  31.97 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  33.23 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  32.69 
 
 		 445 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  29.5 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  29.86 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  29.5 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  27.96 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  30.38 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  30 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  29.18 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  28.57 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  28.01 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  25.91 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  28.29 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  27.57 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.44 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  27.57 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  28.26 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.41 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  32.34 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  28.73 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  30.77 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  30.3 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  28.32 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  32.92 
 
 		 332 aa  52.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>