249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5578 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  100 
 
 		 321 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  58.23 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  53.16 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  52.38 
 
 		 329 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  52.38 
 
 		 329 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  52.38 
 
 		 329 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  51.75 
 
 		 318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50.16 
 
 		 349 aa  331  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  49.53 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  49.05 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  49.84 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  50.16 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  52.04 
 
 		 320 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  49.69 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  50.47 
 
 		 320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  49.68 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  50.94 
 
 		 323 aa  298  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  50.64 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  44.2 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  43.26 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  42.01 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  41.03 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  40.24 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  42.33 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.44 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.89 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  38.54 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  39.7 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.34 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  36.17 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  37.38 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  39.02 
 
 		 332 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  36.05 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  35.74 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.61 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.08 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  36.68 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  32.92 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.14 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  36.14 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  34.78 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  36.68 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  35.62 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.89 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  35.85 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.96 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.58 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  32.63 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  32.39 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.93 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  32.5 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.78 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  33.03 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  32.55 
 
 		 339 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  32.19 
 
 		 503 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  33.96 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.83 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  33.23 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  32.12 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  32.12 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  33.12 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  32.62 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  32.62 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  32.62 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  31.82 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  32.32 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  32.12 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  32.12 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  32.12 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  32.14 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  34.29 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.61 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.49 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  29.27 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.16 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  31.17 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  36.84 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  51.04 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  26.53 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  26.72 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  26.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  29.61 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  29.61 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  29.61 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.32 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2903  putative F420-dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.795057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  29.17 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  27.23 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  29.61 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  26.29 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.02 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>