23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2979 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  100 
 
 		 277 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  48.54 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  46.57 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  44.48 
 
 		 282 aa  215  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  42.05 
 
 		 308 aa  211  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  43.06 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  33.46 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.63 
 
 		 445 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  33.1 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.46 
 
 		 330 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  32.33 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  30.24 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  25.44 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  34.97 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  34.27 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  30.51 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  30.51 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  25.39 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  24.91 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  33.1 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.61 
 
 		 531 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  32 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  26.9 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>