16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0886 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0886  WD40-like protein  100 
 
 		 433 aa  892    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000134516  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.82 
 
 		 616 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  31.82 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.27 
 
 		 901 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  29.57 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 820 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.95 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  29.17 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  30.52 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  21.64 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  25.12 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  24.09 
 
 		 1454 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  27.21 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 861 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25 
 
 		 556 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>