30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1328 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1328  Methyltransferase type 12  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2343  Methyltransferase type 12  34.67 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1034  Methyltransferase type 12  34.92 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00209659  normal  0.0192304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2656  methyltransferase type 12  29.96 
 
 
246 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2070  methyltransferase type 12  29.96 
 
 
246 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8636  methyltransferase type 12  30.58 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3388  Methyltransferase type 12  29.65 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.464354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2688  Methyltransferase type 12  28.93 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  28.92 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  28.97 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4287  Methyltransferase type 11  28 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  28.64 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  23.01 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  21.13 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  21.13 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  23.01 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  21.13 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  21.83 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  21.13 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  21.13 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.5 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  21.13 
 
 
212 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  38.75 
 
 
277 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  46.15 
 
 
344 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  21.13 
 
 
212 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  21.13 
 
 
212 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  40.96 
 
 
298 aa  42  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>