18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1316 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  100 
 
 		 671 aa  1383    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  39.47 
 
 		 1018 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  39.15 
 
 		 1032 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  39.06 
 
 		 1032 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  35.54 
 
 		 656 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  33.53 
 
 		 653 aa  352  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  34.81 
 
 		 653 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  35.11 
 
 		 651 aa  340  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  34.41 
 
 		 663 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  34.59 
 
 		 632 aa  334  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  33.04 
 
 		 659 aa  327  6e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 665 aa  297  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  31.7 
 
 		 640 aa  293  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  31.43 
 
 		 631 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  31.36 
 
 		 631 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.63 
 
 		 629 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  31.19 
 
 		 634 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 702 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>