12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3177 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3177  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1388  branched-chain amino acid transport  47.92 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000854559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2894  branched-chain amino acid transport  47.25 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24933e-22 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4139  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1825  branched chain amino acid ABC transporter  40.48 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1319  branched-chain amino acid transport  39.29 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  35.11 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4738  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0574  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0733  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257385  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3947  branched-chain amino acid transport  38.81 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0696  branched-chain amino acid transport  32.61 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>