36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3573 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  47.69 
 
 
73 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  46.15 
 
 
74 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  45.45 
 
 
73 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  46.15 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  49.28 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  49.23 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  47.06 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  42.62 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  41.27 
 
 
75 aa  57  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  40.32 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  38.46 
 
 
73 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  36.54 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  37.29 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1124  hypothetical protein  38.71 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00431481  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1148  hypothetical protein  38.71 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0669  hypothetical protein  38.71 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  34.55 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3246  hypothetical protein  38.33 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  32.73 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  36.51 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2486  hypothetical protein  36.54 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1030  hypothetical protein  38.46 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514521  normal  0.822013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1026  hypothetical protein  38.46 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5036  hypothetical protein  31.58 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0440839  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5915  hypothetical protein  37.93 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.352211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2370  hypothetical protein  38.18 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233372  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2157  hypothetical protein  35 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109141  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0105  hypothetical protein  36.54 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4817  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550337  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4156  hypothetical protein  32.76 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2145  hypothetical protein  32.69 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.135821  normal  0.0391756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5755  hypothetical protein  36.51 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2322  EGF-like  27.59 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1972  hypothetical protein  34.62 
 
 
74 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>