18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2629 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  90.41 
 
 		 73 aa  141  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  87.67 
 
 		 73 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  90.41 
 
 		 73 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  90.91 
 
 		 55 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  46.15 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  40.58 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  40.98 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  47.46 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  44.07 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  44.64 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  41.94 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  36.36 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  30.91 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  29.09 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  32.73 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  32.86 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>