33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3363 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  100 
 
 		 128 aa  257  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  88.28 
 
 		 128 aa  236  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  75.21 
 
 		 128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  75.21 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  65.22 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  65.22 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  59.65 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  52.29 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  55.26 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  47.32 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  47.32 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  47.32 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0471  hypothetical protein  45.88 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000925994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  36.47 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  36.23 
 
 		 662 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  39.34 
 
 		 671 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  38.98 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  37.7 
 
 		 715 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  40.58 
 
 		 738 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  40.58 
 
 		 738 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  31.34 
 
 		 772 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  37.31 
 
 		 718 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2603  putative cytoplasmic protein  26.67 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2615  hypothetical protein  26.67 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2726  hypothetical protein  25.83 
 
 		 124 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2562  putative cytoplasmic protein  25.83 
 
 		 124 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1274  hypothetical protein  28.1 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00411396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2556  hypothetical protein  24.56 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2777  hypothetical protein  24.56 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2515  putative cytoplasmic protein  35.21 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2647  hypothetical protein  24.56 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00270532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2671  hypothetical protein  24.56 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2605  hypothetical protein  24.56 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0210143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>