32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2556 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2556  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2647  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00270532  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2671  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2605  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0210143  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2777  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2548  hypothetical protein  79.13 
 
 
114 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0284768  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02304  predicted DNA-binding transcriptional regulator  78.26 
 
 
114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000411475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1274  hypothetical protein  78.26 
 
 
119 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00411396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3628  hypothetical protein  78.26 
 
 
114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00496583  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2687  hypothetical protein  78.26 
 
 
114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000217173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02265  hypothetical protein  78.26 
 
 
114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000342341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2535  hypothetical protein  78.26 
 
 
114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000195897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1261  protein of unknown function DUF1323  78.26 
 
 
114 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000484651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2781  hypothetical protein  77.39 
 
 
114 aa  177  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000051142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2929  putative negative regulator  71.68 
 
 
115 aa  150  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2778  hypothetical protein  36.51 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0378849  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2930  hypothetical protein  39.5 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000196021  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2606  hypothetical protein  36.51 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0272315  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2672  hypothetical protein  36.51 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2648  hypothetical protein  36.51 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000364117  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2557  hypothetical protein  36.51 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000359552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3629  hypothetical protein  39.37 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00521171  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02266  hypothetical protein  37.3 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000365685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02305  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.3 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000385128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2780  hypothetical protein  37.3 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1273  hypothetical protein  37.3 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000818109  hitchhiker  0.00416875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2688  hypothetical protein  37.3 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2536  hypothetical protein  37.3 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000244996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1260  protein of unknown function DUF1323  37.3 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000040747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2549  hypothetical protein  38.58 
 
 
130 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0542951  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  28.95 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  24.56 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>