15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3042 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0029  helicase-like  57.39 
 
 		 693 aa  789    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1466  hypothetical protein  59.36 
 
 		 683 aa  827    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  55.27 
 
 		 646 aa  751    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3042  DEAD-like helicase  100 
 
 		 669 aa  1390    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4500  DEAD/DEAH box helicase-like  47.38 
 
 		 692 aa  601  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1963  Pseudomurein-binding repeat protein  45.69 
 
 		 683 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0186142  normal  0.027049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2529  hypothetical protein  46.2 
 
 		 684 aa  588  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0104824  hitchhiker  0.000333956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0264  hypothetical protein  46.43 
 
 		 689 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15590  hypothetical protein  45.61 
 
 		 705 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000202658  unclonable  2.39416e-21 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1751  YeeB-like protein  44.7 
 
 		 702 aa  585  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5332  Sea12  47.08 
 
 		 687 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3314  hypothetical protein  45.38 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1285  YeeB-like protein  45.12 
 
 		 703 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  54.27 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  22.7 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>