273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2803 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2803  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
336 aa  688    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  91.67 
 
 
336 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  89.58 
 
 
336 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  88.1 
 
 
336 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  71.99 
 
 
332 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  71.39 
 
 
332 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  69.58 
 
 
332 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  70.42 
 
 
346 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  68.07 
 
 
332 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.34 
 
 
356 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.92 
 
 
359 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  66.27 
 
 
335 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.97 
 
 
335 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  66.27 
 
 
335 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.67 
 
 
342 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  64.44 
 
 
331 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  63.5 
 
 
338 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  63.88 
 
 
336 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1629  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.77 
 
 
347 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482062  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  64.07 
 
 
337 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.92 
 
 
339 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.23 
 
 
339 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.76 
 
 
341 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4544  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.95 
 
 
341 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  67.95 
 
 
345 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.95 
 
 
345 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.7 
 
 
343 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.69 
 
 
337 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  66.78 
 
 
807 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  64.24 
 
 
336 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  65.76 
 
 
335 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  65.57 
 
 
337 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  63.98 
 
 
330 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1773  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  69.13 
 
 
346 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  68.27 
 
 
345 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.63 
 
 
345 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  66.24 
 
 
329 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6755  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.86 
 
 
341 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  63.08 
 
 
351 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  62.5 
 
 
351 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  67.31 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.31 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  62.65 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.79 
 
 
351 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.87 
 
 
337 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.31 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  61.93 
 
 
329 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.93 
 
 
329 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  61.93 
 
 
329 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1209  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.86 
 
 
327 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0354  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  67.53 
 
 
345 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.271086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.66 
 
 
329 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0806  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  67.53 
 
 
345 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1861  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.86 
 
 
345 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2013  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.86 
 
 
345 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  66.12 
 
 
798 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2480  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.31 
 
 
345 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  61.93 
 
 
329 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  61.93 
 
 
329 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.06 
 
 
340 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  65.26 
 
 
335 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  61.93 
 
 
329 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.18 
 
 
335 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1847  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  67.86 
 
 
345 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  61.93 
 
 
329 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1698  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  67.86 
 
 
345 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0701208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.49 
 
 
337 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  61.63 
 
 
327 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.52 
 
 
345 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  63.24 
 
 
329 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  61.63 
 
 
329 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  63.61 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.19 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.69 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  64.38 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  60.06 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  60.54 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  62.05 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  61.33 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  61.63 
 
 
329 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  61.33 
 
 
329 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.12 
 
 
337 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  61.33 
 
 
329 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  61.33 
 
 
329 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  61.63 
 
 
329 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.24 
 
 
341 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  66.78 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  60 
 
 
335 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0120  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.26 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  63.61 
 
 
338 aa  394  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  63.14 
 
 
329 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.98 
 
 
331 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5896  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.43 
 
 
341 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183484  normal  0.734335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  59.65 
 
 
354 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  61.35 
 
 
336 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  63.96 
 
 
329 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  61.86 
 
 
331 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.87 
 
 
337 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3046  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.33 
 
 
341 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2981  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.82 
 
 
345 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>