21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1780 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1780  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
76 aa  155  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0393744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1864  4-oxalocrotonate tautomerase  71.05 
 
 
76 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.819368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2057  4-oxalocrotonate tautomerase  53.33 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2353  4-oxalocrotonate tautomerase  50.67 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2084  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
76 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1713  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  0.0298053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2195  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2070  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01419  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1642  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1545  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.773724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2186  4-oxalocrotonate tautomerase  47.37 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00899625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2511  4-oxalocrotonate tautomerase  41.89 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0652  4-oxalocrotonate tautomerase  41.89 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.360531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4795  4-oxalocrotonate tautomerase  39.47 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6795  4-oxalocrotonate tautomerase  39.47 
 
 
75 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1349  4-oxalocrotonate tautomerase  37.84 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.667295  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  36.49 
 
 
76 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.15038 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6544  4-oxalocrotonate tautomerase  38.1 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>