29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4132 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4132  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  983    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2798  hypothetical protein  28.03 
 
 
475 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.44646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  24.94 
 
 
460 aa  146  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  30.18 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  31.86 
 
 
452 aa  96.7  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  28.01 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  29.56 
 
 
458 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  28.62 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  27.25 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  34.82 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  25.98 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6743  phosphoesterase PHP domain protein  27.67 
 
 
541 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  30.64 
 
 
425 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  29.83 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  28.96 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1139  PHP domain protein  29.22 
 
 
215 aa  56.6  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2143  hypothetical protein  23.55 
 
 
757 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544193  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  26.3 
 
 
291 aa  53.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2583  phosphotransferase domain-containing protein  36.36 
 
 
364 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  20.7 
 
 
809 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3287  hypothetical protein  21.49 
 
 
813 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0776  PHP domain protein  26.36 
 
 
239 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  26.13 
 
 
225 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2584  hypothetical protein  24.7 
 
 
777 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0639598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1554  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  21.76 
 
 
377 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.832724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  35.53 
 
 
241 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2616  phosphoesterase, PHP-like  34.91 
 
 
371 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2797  PHP domain protein  34.91 
 
 
369 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  55.26 
 
 
574 aa  43.1  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>